Aan de goedkeuring van de stroomgebiedbeheerplannen is een hele weg vooraf gegaan.

Op 8 april 2005 keurde de Vlaamse Regering de eerste waterbeleidsnota goed. In de waterbeleidsnota zet de Vlaamse Regering haar visie uiteen voor een integraal waterbeleid in Vlaanderen.

In 2005 werd de bestaande toestand van het stroomgebied geanalyseerd en geïnventariseerd.  Daarin werden verwerkt:

• een analyse van de kenmerken van het stroomgebieddistrict, inclusief een register van de beschermde gebieden
• een analyse van de belasting van menselijke activiteiten en een beoordeling van de effecten ervan op de toestand van het oppervlaktewater en het grondwater
• een economische analyse van het watergebruik

Eind 2006 werden het tijdschema en het werkprogramma voor de opmaak van de stroomgebiedbeheerplannen bekend gemaakt aan het publiek, samen met de waterbeheerkwesties. Die laatste zijn de grote thema’s die tot gevolg kunnen hebben dat de Vlaamse wateren de goede toestand in 2015 niet bereiken.

Eind 2008 werden de ontwerpen van de stroomgebiedbeheerplannen voor de stroomgebieddistricten van Schelde en Maas en het bijhorende maatregelenprogramma voor Vlaanderen voorgelegd aan het publiek en aan de adviesinstanties (de Sociaal-Economische Raad van Vlaanderen (SERV), de Vlaamse Milieu- en Natuurraad (MINA-Raad), de Strategische Adviesraad voor Landbouw en Visserij (SALV), de bekkenraden en bekkenbesturen). Dat gebeurde tijdens het openbaar onderzoek van eind 2008 tot midden 2009.

Daarna onderzocht de CIW de opmerkingen en adviezen en maakte een overwegingsdocument op. Voor iedere reactie geeft dit document aan op welke manier het ontwerp stroomgebiedbeheerplan of maatregelenprogramma is aangepast of waarom een aanpassing niet aangewezen was.

Eind 2009 legde de Vlaamse Regering bijkomende prioriteiten vast. Dat resulteerde in het werken met speerpuntgebieden om de inspanningen te concentreren.

Op 8 oktober 2010 stelde de Vlaamse Regering de stroomgebiedbeheerplannen voor de Schelde en de Maas en het bijhorende maatregelenprogramma voor Vlaanderen definitief vast. Dit besluit verscheen op 11 januari 2011 in het Belgisch Staatsblad.