Transport
Kanalen typeren en doorkruisen het bekken van de Brugse Polders. Ongeveer 12% van de totale lengte aan waterlopen in het bekken is een effectief bevaarbare waterweg.
De havens van Oostende en Zeebrugge fungeren als economische toegangspoort waarbij de kanalen rond Brugge de schakel zijn voor het transport tussen deze havens en de waterwegen rond Gent. De Vlaamse Waterweg werkt aan een herwaardering van het Kanaal Gent‑Oostende om de vaarweg toekomstbestendig te maken en zijn multifunctionele rol te versterken.
In 2025 werden goederen vervoerd via het Kanaal Gent-Oostende (148.067.200 tonkilometer) en het Boudewijnkanaal (296.953 tonkilometer).
Op het Schipdonkkanaal of Afleidingskanaal van de Leie ("De Stinker") zijn tussen Deinze en het kanaal Gent-Brugge vaartuigen toegestaan van CEMT-klasse Va (“Groot Rijnschip”), met een maximale diepgang van 2,5 m. Tussen het kanaal Gent-Brugge en de sluis van Balgerhoeke is het kanaal enkel bevaarbaar voor vaartuigen uit de CEMT-klasse I (“Spitsen”). Voorbij de sluis van Balgerhoeke is het kanaal niet meer bevaarbaar.
Het Leopoldkanaal ("De Blinker") is een puur afwateringskanaal en wordt niet bevaren. De Damse Vaart die Brugge met het Nederlandse Sluis verbindt, wordt enkel benut door één toeristische boot.
De transportfunctie is naast aan- en afvoer van water de belangrijkste functie van de waterwegen. Het (pro) actief peilbeheer op de waterwegen staat zowel in het teken van het garanderen van voldoende diepgang en veilige doorvoerhoogte onder bruggen e.d. voor de scheepvaart als in teken van voorkomen van wateroverlast en waterschaarste.
Niet alleen de waterwegen zelf maar ook de naastliggende watergebonden bedrijventerreinen kunnen van invloed zijn op het watersysteem. Zo is er bv. door de uitbreiding van de haven van Zeebrugge heel wat watergebonden natuur verloren gegaan. Deze werd in andere poldergebieden binnen het bekken gecompenseerd (vb. Dudzeelse Polders, ' t Pompje in Oudenburg, Uitkerkse Polders).
Incidentele lekken van onder meer smeerolie, diesel en andere, lozingen van afvalwater, gebruik van antifouling, … beïnvloeden de waterkwaliteit van de waterwegen.